LiTS——肝肿瘤分割挑战赛(三)

网友投稿 393 2022-09-20

LiTS——肝肿瘤分割挑战赛(三)

上一篇文章分享了在测试数据上进行肝脏分割,总体效果还是不错的。接下来就要对肿瘤进行分割了,这是非常具有挑战的。

如果大家观察过LiTS的CT图像的话,肿瘤区域是没有固定形态(形状,异质性),而且小肿瘤区域的对比度也非常低,这给我们带来非常大的困难。

简单说一下基本思路吧,其实跟肝脏分割过程差不多,用VNet的2d版本和3d版本来进行分割,详细地过程就不多说了。分析VNet的结果发现肿瘤会出现在肝脏区域内,肝脏边缘和肝脏外部区域。很明显在肝脏外部的肿瘤区域肯定不是肿瘤,接下来重点处理肝脏边缘处的肿瘤区域。我们的目标是在保证肿瘤检出的情况下尽量减少假阳性肿瘤。首先对肝脏分割结果进行凸包计算,并膨胀10个像素,然后再计算肿瘤图像与处理后肝脏图像的交集图像,最后计算交集图像和肿瘤图像中每一个对应肿瘤区域的重叠比值,只保留大于0.8的肿瘤区域。

在验证数据上进行了结果比对(只用VNet2d,只用VNet3d,VNet3d与肝脏交集,VNet2d和VNet3d并集与肝脏交集)。

通过上面结果可以看到第三种方法结果是最好的,所以在70例测试集上采用该方法去推理。提交成绩后,只排在74名。最后我给出第69个病例的分割效果吧,粉色轮廓是肝脏分割结果,红色轮廓是肿瘤分割结果。如果有朋友有更好的经验,欢迎给我留言,相互学习交流。

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